ฟาร์เมอร์เกิดที่เมืองนอร์ธอาดัมส์ รัฐแมสซาชูเซตส์ และเติบโตในวีคิแวชี รัฐฟลอริดา พี่/น้องชายของเขาเป็นอดีตนักมวยปล้ำมืออาชีพ เจฟฟ์ ฟาร์เมอร์ พอล ฟาร์เมอร์จบการศึกษาจากโรงเรียนมัธยมเฮอร์แนนโด บรุคสวิล รัฐฟลอริดา[1] และเข้าศึกษาต่อระดับอุดมศึกษาที่มหาวิทยาลัยดุ๊กในฐานะนักเรียนทุนเบนจามิน เอ็น. ดุ๊ก (Benjamin N. Duke Scholar)[2] เขาจบการศึกษาวุฒิศิลปศาสตร์บัณฑิตเกียรตินิยมอันดับหนึ่งในสาขามานุษยวิทยาการแพทย์เมื่อปี 1982[1][3] จากนั้นเขาศึกษาต่อที่มหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ดและจบการศึกษาด้วยวุฒิแพทยศาสตร์บัณฑิต และปริญญาดุษฎีบัณฑิตสาขามานุษยวิทยาการแพทย์ในปี 1990[3] เขาเป็นแพทย์ประจำบ้านสาขาอายุรศาสตร์ที่โรงพยาบาลบริงแฮมแอนด์วีเมนส์ สำเร็จการศึกษาในปี 1993 และเป็นแพทย์ประจำบ้านต่อยอด อนุสาขาโรคติดต่อ สำเร็จการศึกษาในปี 1996

ฟาร์เมอร์สมรสกับดีดี เบอร์ทรันด์ ฟาร์เมอร์ (Didi Bertrand Farmer) นักมานุษยวิทยาการแพทย์และผู้เชี่ยวชาญด้านเวชศาสตร์ชุมชนชาวเฮติผู้ได้ร่วมงานกันหลายครั้งในหลายโครงการพัฒนาบริการสุขภาพ งานของเธอในปัจจุบัน (2020) มุ่งเน้นที่การพัฒนาและสร้างความมั่นใจเด็กผู้หญิงและสตรีวัยรุ่นในเฮติกับรวันดา[4] ทั้งคู่มีบุตร/ธิดารวมกสามคน[5]